青牛村东头的灵植园在子夜时分突发异变。那株百年不枯的月华草竟在月光下疯狂生长，藤蔓如碧玉蛟龙般缠绕住整片药田。刘镇南盯着草叶上浮现的银色纹路，发现这些纹路正随着月相变化而流转。
五更时分，异变加剧。园中所有灵植无风自动，叶片相互摩擦发出金玉相击之声。老药农发现，平日里温顺的七星菇竟渗出漆黑如墨的汁液，沾染到的土壤瞬间化作焦土。
镇南，快看灵泉！林素衣惊呼道。只见园中那口千年灵泉沸腾如煮，水面上浮现出无数扭曲的面容。更可怕的是，泉底不断涌出血色泡沫，整个药园弥漫着刺鼻的铁锈味。
新任灵植使踏月而来，手中玉锄轻挥，整片药田的草木瞬间妖化。山野村夫，也配培育通灵草木？他冷笑间，地底钻出万草阁用怨气炼制的噬心蛊。刘镇南临危不乱，引动晨露化作细雨洒向蛊虫。
月圆之夜，真正的灾劫降临。灵植长老撕裂虚空现身，袖中飞出的种子落地即成妖植。这些妖植根须如铁索，专噬地脉灵气，被缠住的村民以肉眼可见的速度衰老。更可怕的是，它们正在将整座青牛村转化为活祭阵眼。
七日苦战，刘镇南耗尽本命精血。就在他力竭之际，林素衣残魂显现，将毕生所学凝成《万草真解》。可就在这时，万草阁主真身降临，他脚踏食人花，腰间的摄魂铃摇出惑心魔音。
关键时刻，刘镇南福至心灵。他咬破指尖，将鲜血滴入古井。血珠入井竟映出百草朝宗异象，井水冲天而起化作甘霖。新生的净灵草破土而出，草心端坐三寸木灵，手持药杵净化妖气。
但危机远未结束。万草阁主祭出本命法宝万毒幡，幡风过处，草木尽枯。眼看全村即将遭劫，林素衣残魂彻底燃烧，化作光罩护住村庄。毒气触及光罩竟化作灵气，原来她早已将本命木灵炼成了净世明灯。
寒露深夜，当最后一道妖藤断裂时，幸存的灵植突然迸发七彩霞光。光华中，一株通天建木拔地而起，树冠直入云霄。更神奇的是，树身上天然生长着完整的《草木天书》。
谷雨时节，天书现世引来四方争夺。最先到来的是海外灵植宗，他们驾驭着飞花辇布下天罗地网。危急时刻，林素衣残魂引动地脉，整座村庄突然浮现出天然灵阵。
小满午夜，幽冥毒尊破开封印，欲夺天书重写三界秩序。刘镇南借天书之力，在九天之上展开终极对决。当最后一道毒瘴消散时，天书突然化作流光没入建木之中。
从此，这株通天建木成了青牛村的守护神树。每逢月圆之夜，树冠会洒下甘霖，治愈村民伤病。更神奇的是，树身上会自然结出各种灵果，食之可延年益寿。
但福兮祸所伏，建木的神异引来了更可怕的觊觎者。立夏那日，天外飞来九只金乌，口吐太阳真火欲要焚毁建木。就在千钧一发之际，建木突然绽放万丈青光，树冠上浮现出青龙虚影。
原来这株建木竟是上古青龙殒落所化，树心封印着青龙残魂。金乌见状大惊，正要逃离，却被青龙一爪擒住，化作九轮金阳环绕树冠。
从此，青牛村有了永不坠落的九轮金阳，建木也成了连接天地的桥梁。而刘镇南与林素衣，则在这株神木的庇护下，开始了新的修行之路。
惊蛰春雷中，建木突然开花结果。更神奇的是，果实落地即化成人形，个个眉清目秀，天生能与草木沟通。这些木灵称刘镇南为父，奉林素衣为母，在村中建起了木灵一族。
谷雨时节，木灵族展现出惊人天赋。他们能令枯木逢春，能让顽石生苔，更神奇的是，他们的眼泪可解百毒，笑声可愈顽疾。整个青牛村在他们的经营下，成了人间仙境。
但木灵族的降生，也引来了天界的注意。立秋那日，南天门大开，天兵天将下凡，要带木灵族上天庭效力。一场关乎三界格局的大战，即将拉开序幕......
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