明弘光二十年、日本后西天皇宽文四年、西历1664年七月十四日，大明特使抵达骏府，并于当日向骏府三人众（注：城代、港代、町奉行）递交了一份措辞严厉的国书。
在这份国书中，大明朝廷要求德川幕府立刻赔偿日西联合舰队给新薛港造成的损失、严惩相关肇事人员、并声明永远放弃对方壶的殖民计划和就此终止与西班牙人的贸易往来。
由于大明特使声明自己只在骏府港停留五天，五天内幕府不做令大明满意的答复的话，他就会返回南京禀报，因此产生的一切后果由幕府承担；所以，接到国书的骏府三人众不敢怠慢，第一时间就派町飞脚把大明国书送往了江户。
接到骏府递送国书的幕府外交奉行、北之庄藩藩主松平光长看完国书后大惊失色，立刻向将军德川家纲及老中会议进行了报告。
23岁的将军家纲及一众老中们也被这意外事件所震惊，但由于关键消息的缺失，所以他们无法验证大明方面说法的真伪，就只能先行决定派人前往骏府与大明特使沟通，然后才根据沟通结果给予答复。
当然，由于已经被大明收拾过了一次，所以幕府方面极度担心明军会再次兵临城下，以武力来讨说法，因此，将军家纲随后立刻以前往日光东照宫避暑为名带着大奥众人离开江户。
等将军离开江户后，留守江户的老中会议随即秘密颁布了动员令，以组织“八万”旗本和部分亲藩做近期爆发战争的准备。
虽说动员令是秘密颁布的，但大规模召集旗本和亲藩武装的动静根本不能掩饰，再加上将军突然离开江户遁入内地，因此江户居民立刻被惊动了，其中能跑的大名眷属纷纷以陪同将军前往日光的名义逃离江户，而普通江户百姓也慌慌张张的离开江户逃入乡下，由此上演了一出风声鹤唳草木皆兵的好戏。
按下江户一日三惊不说，被老中会议派往骏府的幕府外交奉行松平光长因为不会骑快马，所以便乘坐了幕府建造的120吨级洋船【霞之浦】号连夜赶往骏府，但饶是【霞之浦】号的速度飞快，也将将在七月十九日早上才将松平光长送到了骏府。
注意到时间已经不太够了的松平光长，顾不得一路上晕船呕吐造成的身体损失，只是在城代家中洗了个澡、换了件衣物便约见了大明特使。
大明特使如约而至后，光长再三表示，大明方面是不是搞错了，井伊直澄没有那么大胆子；然而大明特使提供了一份七十多人的口供，直接打脸了光长的说法；见大明死后有铁证在手，为了避免问题扩大化，光长立刻根据老中会议的授权同意了向大明的赔偿。
不过关于大明提出幕府赔偿八百万银贯的要求，幕府这边就只愿意支给五十万贯，因此需要松平光长去讨价还价一番；此外，幕府也不太愿意放弃与西班牙的海贸，更不愿意放弃对北美洲的拓殖，所以，幕府能爽快答应的是对井伊直澄以下肇事者予以最严厉的处置。
但大明特使却告知松平光长，【难波丸】号已经被大明水师击沉、新大和领地也已经被明军攻克，两者的幸存者中，井伊直澄已经畏罪自杀，其余人则被大明充作了苦役，所以大明所谓幕府严惩肇事者的要求，是要求幕府交出相关人员的家属，以便大明向他们追责。
松平光长郁闷的要吐血，就只能请求大明特使再给一些时间，让他能通报江户获得必要指示；对此，大明特使颇有些通情达理的同意了；于是，松平光长便立刻将【难波丸】号、新大和岛易手的消息通报了江户，并同时转述了大明特使的要求。
把回江户的信使送上【霞之浦】号后，松平光长忽然想到了什么，便联系大明特使，要求大明水师手下留情，不要进攻半个月前离开日本，前往新大和岛运输移民及前往墨西哥贸易的幕府洋船【新伊达丸】号。
可这个要求被大明特使以无法及时联系方壶那边为由给拒绝了，对此，已经通过部分大明海商了解到大明国内有所谓无线电报的松平光长恨得牙根痒痒，却也只能自认倒霉。
正当松平光长极力压抑内心不满的时候，大明特使却意外的给了幕府另外一个选择。
旧话重提的大明特使暗地里向光长表示，如果将军家纲废黜京都天皇世系，接受大明册封、成为大明藩属国王，那么除了禁止日本在海外拓殖不能谈外，其他都可以商量的。
兹事体大，松平光长只能跟大明特使申请更多时间与江户沟通。
大明特使便给出了最后期限：限幕府于当年八月十五日之前，给出最后答复。
既然时间还算宽泛，光长便试着与大明特使进行交流，就幕府取代京都朝廷可能引发的诸侯叛乱提出了担心。
大明特使告诉光长，只要幕府同意废掉京都的天皇世系，大明会协助幕府稳定日本的局势。
光长便派人从陆路赶回江户报告。
接到一前一后两份报告的老中会议出现了严重的分裂，预计短时间内没办法取得一致结论，但大明特使给的最后时限也是无法拖延的，所以，一众老中便急忙赶往将军临时驻跸的户田天满宫----家纲虽然说要前往日光避暑，但实际只是把女眷限送往了日光，自己过了荒川后便停下来观望江户局势----请求将军决断。
家纲对于大明再三要求废止日本旧皇统十分奇怪，因此根本不想答应大明的要求，但若是不答应大明的通牒，那么战争无法避免，一旦幕府再度兵败，只怕德川家就很难再压制各地诸侯了，所以，幕府准备了两套应对方式，大明可以在赔款等问题上进行商量，幕府宁可多赔一些钱，反之，就只能冒险答应大明废掉京都天皇世系的要求了。
当年八月十五日，松平光长代表幕府与大明特使进行了最终谈判，结果，大明特使寸步不让，无可奈何之下，松平只能以幕府名义与大明签署了《骏府密约》。
《骏府密约》规定，幕府就【难波丸】号事件向大明赔款五十万银贯，并承诺今后不再向美洲移民，当然最关键是，幕府保证在半年内废掉京都朝廷，将军家纲以日本国王的身份接受大明册封，成为大明外藩；而大明则同意就此了结【难波丸】号事件及后续引发的明日冲突，不再追究幕府方面的责任、也不阻止日本维持与墨西哥的贸易······
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