谓废止八旗，缘起于维新三年年中，但整个过程一直10年。因为，对一样根本性制度的调整，涉及到方方面面的利益与纠葛，虽然皇帝借着平定亲贵叛乱的势头以雷霆万钧的手段加以勉力推进，但在具体做法上，依然积极稳妥。
以旗兵为例，京师八旗因为驻所地由禁卫军等担任卫戍任务，原本就不甚仰仗，废了亦无大事。但像偏远地区，譬如黑龙江、譬如西安，都驻有大批旗兵，而且旗兵无论吃苦性与担任的卫戍任务都要强于京师八旗，那就不是简单的废止。
又譬如汉军旗，满八旗要废止，汉军旗同样也会跟着废止。如果不给他们相应的优待，则汉军旗必定要起来造反，即便不造反，数百万人怀有怨望也说不定是未来的巨大隐患；但如果给他们与满八旗相应的待遇，不要说满八旗会大有意见，就是帝国财政亦难以接受。最后经过商定，汉军旗废旗的，安家费发30元，但加上豁免今后5的地丁钱粮这一条款。双方便是皆大欢喜。
除了满汉八旗以外，蒙古八旗也是令人相当棘手的问题。皇帝汲取了历史上清廷在蒙古强硬推行新政，结果造成蒙古王公对中央政权离心离德的教训，对蒙古方面的改革极为慎重，对蒙古王爷也格外予以优容。最后商定了八项解决意见：
1、蒙古八旗制度，以所在旗王公意见为准，存废悉听尊便。朝廷不予干涉。但王公爵位继承不得朝廷册封诏书者，视为僭越；
2蒙古可选代表出席帝国国会，名额遵照相应法律，但国会代表如何选定，由蒙古各旗自行商议办法后报朝廷批准；
3无论蒙八旗存废与否，蒙古王公所辖卫队不得超过400，不得私自组军。蒙古壮丁纳入国防部统一的征兵范围，按《帝国国防法》予以编制，不得违逆；
4蒙古境内土地准自由买卖。但不得售于外人。蒙人售于满人、汉人者，亦不得阻拦，亦允蒙人入内地收买田产、房产；
5蒙古境内如铁路、公路、电报局等设施之营建经费。悉由朝廷承担，所占土地亦以公允价购买，但当地王公不得以其他理由阻挠之；
6蒙古境内的度量衡、钱币、法律等一切制度，须与朝廷改良后地制度保持一致，但允许保留蒙古传统与民族特色。朝廷亦极尊重蒙古传统宗教；
7蒙古子弟倘有聪颖且愿意出洋留学者，可由帝国教育部予以考核后直接放洋或入本国大学堂受学预科。经费由朝廷承担；
8蒙古王公每家应抽调1～2年10岁以上，15以下子弟入京受学。
对蒙古地政策如此，对西藏的政策也是如此。皇帝的意思非常明确，这两处地方，版图大、人烟少，文化、交往都处于极其闭塞的境地，传统习惯力量尤强，对他们加以现代化改造决不可操之过急。最好的办法便是保持朝廷的传统掌控与影响，同时增加对现代化信息的沟通与交流，通过潜移默化地渗透而不是强制性的行政命令来改变旧有习俗。同时，皇帝鉴于后世民族政策的教训，只尊重蒙、藏两族地民族特色，但并不授予其高于其他民族地权利。
消除民族域，不仅指消除满汉域，同样也要消除蒙汉域、藏汉域、满蒙域等因素。
以维新三年九月初九颁布《蒙古八旗制度筹划上谕》为标志，满蒙300来的特殊纽带和政治联姻关系宣告在形式上予以消灭，帝国从此视蒙古各部与天下众民一般，蒙古部落亦不必对朝廷承担额外的义务。当然，作为既有历史地传承，蒙古、满族与帝国朝廷的特殊联系不可能一并消逝，皇帝本人在当年就纳了蒙古美女海琳为妃，册封为仪妃，成为皇帝维新以来所纳的第三名妃子。
为进一步稳定民族关系，加强边疆向心力，接下来两个月，皇帝接连颁布《回部绥靖筹划上谕》与《藏部绥靖筹划上谕》两封诏书。朝廷改变了过去300间对回部的仇视、敌视态度，第一次承认回部拥有与其他各民族相等的平权，愿意授予回部在本民族聚居区域类似于蒙古地自治权，可以
定官吏，愿意尊重伊斯兰教在回部的传教权，回部亦国会代表地名额，一个为弼德院，另两个为资政院，标志着回部以正常的政治身份参与国家大事，不再负有200来回部势力稍盛便招来仇杀的包袱，亦不再有左宗棠征回这样的军事规模。回部历经数百年，通过竭力抗争而不得的民族自主权力，不料竟在一夕之间便得到，皇帝的仁名远远歌颂。虽然一纸诏书很难将各民族间上百年的恩怨一朝化解，但有了正确的民族政策，民族纠纷与隔阂总有破冰的结局。
朝廷与西藏的关系因为涉及到中英关系，相对而言比较敏感。皇帝虽然着眼于恢复朝廷对西藏当局的传统影响力，但英、印当局对西藏的渗透已到了无以复加的地步。更何况，四川等藏边区域本身并未安定，短时间内出台强硬的军事解决方案并无可行性，出台进一步稳固、笼络藏部的政策，减少在西藏强制推行新政的努力，以稳定大局的妥协适应于西藏当前的情况。当然，这只是皇帝不得已而为之的过渡政策。
随着八旗制度的逐渐废止，民族域的逐步消融，皇帝对原有的爵位制度亦进行了重大改良。
原本帝国爵位分为宗室爵和功臣爵两种。宗室爵包括和硕亲王、世子亲王嫡子、多罗郡王、长子郡王嫡子、多罗贝勒、固山贝子、镇国公、辅国公、不入八分镇国公、不入八分辅国公、一至三等镇国将军、一至三等辅国将军、一至三等奉国将军、奉恩将军共14辅国公之前八等称入八分公，与之后的不入八分镇国公、不入八分辅国公等爵位不同。而功臣世爵分为公、侯、伯、子、男、轻车都尉、骑都尉、云骑尉、恩骑尉九级27等。
根据维新三年十二月初九颁行的《大中华帝国爵位法》规定，帝国爵位不再区分宗室爵和功臣爵两种，统一纳入一个爵位体系，均称帝国爵位，同时取消原有爵位与官员品秩挂钩的制度。
新的爵位体系里面，分成亲王、郡王、贝勒、贝子、公一至三等、侯一至三等、伯一至三等、子一至三等、男一至三等、轻车都尉、骑都尉、云骑尉、恩骑尉共13级，27级。
《爵位法》规定，亲王、郡王、贝勒、贝子为皇室爵，无皇室血统者不得授予，原有宗室爵中的世子和长子两级分别改授贝勒和贝子，皇帝之子从贝子开始授爵，镇国公、辅国公对应为新爵位中的一至二等公，不入八分镇国公、不入八分辅国公对应为新爵位中的一至二等候，一至三等镇国将军对应一至三等伯、一至三等辅国将军对应一至三等子爵、一至三等奉国将军对应一至三等男爵。
《爵位法》同时规定了爵位的继承，区别为世袭罔替与非世袭罔替两种，倘若是世袭罔替的爵位，那么授予此爵位后，子孙后代继承的仍然是这个爵位，级别不会发生动摇，倘若是非世袭罔替的爵位，则每过一代子孙所继承的爵位就要降等，防止子孙躺在先人的功劳簿上不思进取。但新《爵位法》与旧有规定出入较大的主要有两个方面，一是降等，原有爵位法规定一代只降一等，新的爵位法规定一代降三等，最多九代降完，二是授爵时间，原先宗爵子弟一出生就有爵位，现在规定只有年满15岁，接受完基本教育，通过考核的才能袭爵，避免+亲王，两个月大的云骑尉这样的尴尬场景。
由于大批亲贵已经在叛乱中被消灭或褫夺爵位，剩余的前不久都晋封了一级，因此《爵位法》的颁行并未受到阻力，而由于功臣爵与宗室爵的一体化，让所有舆论都评论认为，皇帝实践“满汉一体”、“融合域”的目标是努力且真诚的。
维新四年正月过后，全天下的臣民都在关注皇帝的子嗣与将来的地位继承，根据《帝国日报》披露的消息，再过半个月，陈璇和容龄都将临盆，她们两人谁能能诞下皇子，谁家就有可能入继大统，甚至还有可能问鼎中宫……第三次机遇 第三卷 第九十五章 制度改良
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