他身边几位高能物理组的研究员也纷纷附和：
“刘院士说得对，我们的希格斯粒子性质研究也受到了影响。”
“是啊，‘神威’的架构本来就更适合我们这种大规模数值计算，生物信息学的很多算法在上面跑，优化起来事倍功半，何必呢？”
“他们这是吃着碗里的，看着锅里的。有了定制大餐，还来抢我们的工作餐，太过分了！”
会议室里的目光都聚焦在科技部协调员和超算中心负责人身上。
负责人面露难色，看向协调员。
协调员是一位沉稳的中年人，他清了清嗓子，开口道：“刘院士，各位专家，请息怒。”
“情况是这样的。首先，国家特批给繁缕研究院使用‘神威’，是在‘方舟’建成之前，为了抢抓科研机遇窗口期，避免因计算瓶颈导致重大科研成果流失的紧急举措。这一点，是经过最高层面权衡的。”
他顿了顿，继续解释：“其次，关于‘方舟’建成后是否还需要‘神威’的问题。根据我们与陆时羡院士团队的沟通和评估，主要有两个考量。”
“第一，‘方舟’是生物专用超算，其架构针对生命科学的多模态、非结构化数据和高通量动态模拟进行了深度定制。”
“但在一些基础的、大规模的通用科学计算任务上，‘神威’经过多年优化，其稳定性和效率在短期内仍然是不可替代的。两者是互补，而非替代关系。”
“第二，也是更关键的一点，‘方舟’一期工程预计需要至少12-14个月才能交付使用。而科学研究，尤其是竞争如此激烈的领域，等不起这整整一年。”
“陆院士团队目前在‘神威’上进行的，正是基于他们最新发现、最可能产生突破的关键验证性计算。如果现在中断，不仅前功尽弃，也可能错失良机。”
刘院士的脸色并没有因此缓和，他追问道：“那总有个时限吧？不能无限期地让他们独占优质资源！我们的项目就不是国家项目了吗？”
协调员点了点头：“这一点请放心。特批是有时限的。我们与繁缕研究院有明确的约定，在‘方舟’一期原型系统交付并稳定运行之后，他们在‘神威’上的独占性高优先级权限将自动解除，转为常规排队。这个时间点，预计在十个月之后。同时，我们也在积极协调，为受影响的各组争取在其他国家级超算中心补偿计算资源，尽力减少大家的损失。”
听到有明确的退出机制和补偿方案，会议室里的不满情绪稍微平息了一些。但刘院士依旧叹了口气，语气复杂：
“我不是不支持交叉学科，也不是不认可陆院士的成就。只是……这种资源倾斜的力度，在我几十年的科研生涯中，实属罕见。希望他们真的能拿出配得上这份投入的成果，否则，难以服众啊。”
消息传到繁缕研究院，陆时羡只是淡淡地对罗伯特教授说：“听到了吗？罗伯特。我们不仅是在和国际同行赛跑，也是在和国家内部的其他重要领域赛跑，在用掉本该属于他们的资源。我们拿出的成果，必须十倍、百倍于我们消耗的这些算力，才能对得起这份压力和期待。”
罗伯特教授闻言，神色也凝重了许多，他望向机房的方向，喃喃道：“我现在感觉，这些计算周期，每一个都重若千钧。”
攻关小组的成员们几乎住在了机房，靠着浓咖啡和一股不服输的劲头，一个又一个地攻克技术难关。
陆时羡虽然没有亲自编写每一行代码，但他始终坐镇指挥。
他对计算机科学的了解的确没有其他学科深入，但拥有的深厚交叉学科背景，能够帮助团队理解生物学问题的本质，确保计算优化的方向始终服务于最终的科学目标，而不是陷入纯粹追求计算性能的误区。
比如他会指着某个模拟结果问：“这个构象的能垒是否合理？”或者看着网络模型的输出说：“这个节点的连接度异常偏高，是需要优化的计算伪影，还是它真的提示了一个我们忽略的生物学关键点？”
辛勤的汗水终于换来了回报。
当经过深度优化的程序开始在“神威”上稳定运行，海量的计算任务以前所未有的速度完成时，惊喜开始不断涌现。
第一个发现是SFR-1的“双面人格”。
在之前基于“鸿蒙”的、时间尺度较短的模拟中，SFR-1被认为主要与激活状态的GpcR相互作用。
但在“神威”上进行的、长达微秒级的高精度分子动力学模拟中，团队惊讶地发现，SFR-1的某个特定结构域，在特定的膜脂环境和小分子配体，可能是细胞内未知的第二信使存在的条件下，会表现出一种奇特的“双面性”。
即它既能与激活态的GpcR结合，也能以一种不同的构象，与某些处于“预备”或“失活”状态的GpcR发生弱相互作用。
“这暗示SFR-1可能不仅仅是一个被动的‘连接器’，它本身可能参与了对GpcR状态的‘感知’和‘选择’，就像一个智能开关，能判断哪些信号值得放大和传递。”罗伯特教授看到这个结果时，激动地指着屏幕上的动态轨迹说道。
第二个发现是“孤儿domain”的潜在功能。
埃琳娜团队提供的更高分辨率的冷冻电镜结构，结合“神威”上运行的、更复杂的柔性拟合和分子动力学模拟，为那个功能未知的“孤儿domain”提供了全新的线索。
模拟显示，这个domain并非刚性结构，而是一个高度动态的、富含带电氨基酸的“触手”。在模拟中，它表现出与多种不同SNARE蛋白组分相互作用的倾向，但其结合强度和特异性，似乎受到SFR-1其他区域构象的变构调控。
当SFR-1与GpcR结合后，这个‘触手’的构象熵明显降低了，变得更加有序，这很可能增强了它与特定SNARE蛋白的结合能力！
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